Muhafadhoh merupakan suatu metode menghafal kitab yang ada di lembaga pondok pesantren. Pengimplementasiannya yakni dengan cara seorang guru menyuruh pada muridnya untuk mengahafal sutu kitab dan
menyetorkan sesuai waktu yang telah ditentukan. Pondok Pesantren Assalafie juga menggunakan metode ini, dengan menggunakan metode ini seluruh santri diwajibkan mengahafal kitab yang sesuai dengan tingkatannya masing-masing. Dimulai dari menghafal sifat wajib bagi Allah, asmaul husna, tasrifan, dan kitab aqidatul awam, kitab awwamil Al-Jurjani, kitab Al-Jurmiyah, kitab Al-Amrity, dan sampai kitab Alfiyah Ibnu Malik. Sebenarnya hafalan ini sesuai tingkatan madrasah di Madrasah AlHikamussalafiyah nya, yang dimulai dari tingkat Ibtidaiyyah kelas 3,4,5, dan 6 sampai tingkat Tsanawiyah 1,2 dan 3.
Kegiatan muhafadhoh pesantren Assalafie ini dilaksanakan setiap satu pekan sekali yang disetorkan pada guru atau yang lebih dikenal dengan mudarisnya masing-masing setiap malam kamis. Dan setelah empat
bulan, pondok assalafie mengadakan muhafdhoh kubro yang menjadi syarat untuk kenaikan kelas di pengajian halaqoh ba‟da magrib. Muhafdhoh kubro ini di wajibkan bagi seluruh santri assalafie tingkat
Ibtidaiyyah dan Tsanawiyah MHS, jika tidak mengikutinya maka tidak naik kelas